Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms