Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHTOPQ9Y3Y2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms