Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXD3Q9UJU5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms