Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIMS3Q9UJD0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms