Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SRBD1-203ENST00000475073 567 ntTSL 48.41□□□□□ -1.063e-18■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.283e-18■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 XPO6-219ENST00000570033 558 ntTSL 47.04□□□□□ -1.283e-18■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.413e-7■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.433e-7■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 RPS15A-212ENST00000576008 589 ntTSL 1 (best)5.9□□□□□ -1.462e-21■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 RPS15A-202ENST00000562935 427 ntTSL 25.9□□□□□ -1.462e-21■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 RPS15A-207ENST00000569365 481 ntTSL 35.9□□□□□ -1.462e-21■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.523e-7■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.553e-7■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 RPS15A-210ENST00000574723 418 ntTSL 35.3□□□□□ -1.562e-21■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 C11orf24-206ENST00000531745 451 ntTSL 53.41□□□□□ -1.863e-18■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 144.1
UTP3Q9NQZ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.582e-6■■■■■ 144
UTP3Q9NQZ2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 144
UTP3Q9NQZ2 ERGIC1-209ENST00000520642 539 ntTSL 416.44■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 144
UTP3Q9NQZ2 ERGIC1-207ENST00000520326 647 ntTSL 515.18■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 144
UTP3Q9NQZ2 TMEM43-201ENST00000306077 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.856e-8■■■■■ 144
UTP3Q9NQZ2 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 143.9
UTP3Q9NQZ2 TMEM250-204ENST00000557985 1981 ntTSL 1 (best)23.25■■□□□ 1.316e-7■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-215ENST00000510319 557 ntTSL 420.87■□□□□ 0.934e-9■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-224ENST00000514527 660 ntTSL 320.7■□□□□ 0.94e-9■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-225ENST00000514873 542 ntTSL 416.41■□□□□ 0.224e-9■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF317-203ENST00000419608 744 ntTSL 215.47■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-222ENST00000513974 548 ntTSL 414.02□□□□□ -0.174e-9■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-203ENST00000502736 569 ntTSL 411.96□□□□□ -0.494e-9■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-206ENST00000504052 630 ntTSL 410□□□□□ -0.814e-9■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-213ENST00000508777 1387 ntTSL 1 (best)9.25□□□□□ -0.934e-9■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 CHD6-206ENST00000470470 1349 ntTSL 57.37□□□□□ -1.234e-6■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-212ENST00000508315 579 ntTSL 47.04□□□□□ -1.284e-9■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-204ENST00000503222 562 ntTSL 45.8□□□□□ -1.484e-9■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-219ENST00000512625 554 ntTSL 45.16□□□□□ -1.584e-9■■■■■ 143.8
UTP3Q9NQZ2 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.024e-8■■■■■ 143.7
UTP3Q9NQZ2 PPIG-202ENST00000409714 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.581e-10■■■■■ 143.6
UTP3Q9NQZ2 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.51e-10■■■■■ 143.6
UTP3Q9NQZ2 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.521e-10■■■■■ 143.6
UTP3Q9NQZ2 FAM13A-213ENST00000509094 2762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.514e-8■■■■■ 143.6
UTP3Q9NQZ2 FAM13A-219ENST00000512339 1511 ntTSL 510.86□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 143.6
UTP3Q9NQZ2 FAM13A-222ENST00000515600 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.734e-8■■■■■ 143.6
UTP3Q9NQZ2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 MUM1-211ENST00000591433 2603 ntTSL 517.78■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 POGZ-203ENST00000368863 6054 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 POGZ-212ENST00000485040 2741 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -11e-7■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 POGZ-202ENST00000358476 6459 ntTSL 27.12□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 UHRF2-209ENST00000481049 635 ntTSL 523.28■■□□□ 1.324e-7■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 UHRF2-205ENST00000468435 3723 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 GALNT2-205ENST00000494106 692 ntTSL 514.61□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 143.4
UTP3Q9NQZ2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.063e-10■■■■■ 143.3
UTP3Q9NQZ2 PLXNB2-212ENST00000496720 913 ntTSL 318.06■□□□□ 0.487e-7■■■■■ 143.3
UTP3Q9NQZ2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 143.3
UTP3Q9NQZ2 SMYD3-202ENST00000366517 1372 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 143.2
UTP3Q9NQZ2 HSF4-218ENST00000522023 636 ntTSL 419.8■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 143.2
UTP3Q9NQZ2 SMYD3-212ENST00000483072 466 ntTSL 29.13□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 143.2
UTP3Q9NQZ2 AMBRA1-205ENST00000526606 522 ntTSL 420.61■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 143.1
UTP3Q9NQZ2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.839e-8■■■■■ 143.1
UTP3Q9NQZ2 GGA2-215ENST00000569189 586 ntTSL 525.92■■□□□ 1.748e-7■■■■■ 143.1
UTP3Q9NQZ2 GGA2-212ENST00000568799 1403 ntTSL 522.43■■□□□ 1.188e-7■■■■■ 143.1
UTP3Q9NQZ2 GGA2-205ENST00000563494 553 ntTSL 522.22■■□□□ 1.158e-7■■■■■ 143.1
UTP3Q9NQZ2 GGA2-217ENST00000570111 563 ntTSL 58.94□□□□□ -0.988e-7■■■■■ 143.1
UTP3Q9NQZ2 GGA2-216ENST00000569300 572 ntTSL 46.12□□□□□ -1.438e-7■■■■■ 143.1
UTP3Q9NQZ2 SSSCA1-202ENST00000526433 739 ntTSL 317.35■□□□□ 0.379e-7■■■■■ 143.1
UTP3Q9NQZ2 CKAP5-211ENST00000532321 586 ntTSL 45.65□□□□□ -1.56e-7■■■■■ 143
UTP3Q9NQZ2 EHMT1-249ENST00000637949 575 ntTSL 59.4□□□□□ -0.95e-11■■■■■ 143
UTP3Q9NQZ2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 142.9
UTP3Q9NQZ2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 142.9
UTP3Q9NQZ2 PTDSS2-203ENST00000525727 837 ntTSL 1 (best)22.72■■□□□ 1.239e-8■■■■■ 142.9
UTP3Q9NQZ2 CARD9-203ENST00000460290 1061 ntTSL 326.56■■□□□ 1.843e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 CARD9-206ENST00000489932 1912 ntTSL 520.98■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.853e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 CARD9-204ENST00000481053 4060 ntTSL 219.84■□□□□ 0.773e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 218.73■□□□□ 0.593e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 CARD9-205ENST00000485975 4574 ntTSL 217.74■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 517.03■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 METAP1-205ENST00000507537 718 ntTSL 316.78■□□□□ 0.287e-8■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 ZBTB38-211ENST00000510338 644 ntTSL 216.62■□□□□ 0.253e-8■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 215.48■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 PSMB7-206ENST00000498485 967 ntTSL 514.95□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 214.74□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 GOT2-203ENST00000492378 987 ntTSL 213.38□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 142.8
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