Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARFGAP3Q9NP61 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms