Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPL3Q9BY60 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms