Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL3Q9BXA9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms