Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms