Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS3Q9BQ31 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms