Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms