Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms