Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNAQ96QF7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms