Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JSRP1Q96MG2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms