Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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GTF3C6Q969F1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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GTF3C6Q969F1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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GTF3C6Q969F1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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GTF3C6Q969F1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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GTF3C6Q969F1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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GTF3C6Q969F1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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GTF3C6Q969F1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF3C6Q969F1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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