Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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USP43Q70EL4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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USP43Q70EL4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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USP43Q70EL4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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USP43Q70EL4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP43Q70EL4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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