Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRIG3Q6UXM1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms