Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms