Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms