Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GARNL3Q5VVW2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms