Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms