Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCTE1Q5JU00 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms