Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FREM1Q5H8C1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FREM1Q5H8C1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FREM1Q5H8C1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FREM1Q5H8C1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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