Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SSX1Q16384 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SSX1Q16384 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SSX1Q16384 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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