Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6AP1Q15904 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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