Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.092e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.456e-9■■■■□ 22
PCBP2Q15366 RBCK1-214ENST00000621487 473 ntTSL 214.96□□□□□ -0.011e-29■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZSCAN5A-216ENST00000592679 923 ntTSL 220.45■□□□□ 0.864e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.164e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZSCAN5A-215ENST00000592509 589 ntTSL 213.01□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZSCAN5A-205ENST00000587340 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZSCAN5A-209ENST00000588955 576 ntTSL 410.96□□□□□ -0.654e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZSCAN5A-217ENST00000593106 849 ntTSL 59.92□□□□□ -0.824e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZSCAN5A-208ENST00000588442 576 ntTSL 46.86□□□□□ -1.314e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZSCAN5A-211ENST00000590675 570 ntTSL 26.05□□□□□ -1.444e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 SCRIB-204ENST00000525051 1685 ntTSL 1 (best)18.61■□□□□ 0.573e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 SCRIB-205ENST00000526832 2189 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.553e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 AC074212.1-202ENST00000592217 1420 nt22.17■■□□□ 1.141e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.043e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 517■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 315.68■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 315.46■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZSCAN5A-212ENST00000591078 686 ntTSL 311.15□□□□□ -0.626e-8■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZSCAN5A-210ENST00000589279 686 ntTSL 28.99□□□□□ -0.976e-8■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZSCAN5A-202ENST00000585670 314 ntTSL 38.91□□□□□ -0.986e-8■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZSCAN5A-207ENST00000587614 589 ntTSL 47.4□□□□□ -1.226e-8■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZSCAN5A-204ENST00000587075 641 ntTSL 35.35□□□□□ -1.556e-8■■■■□ 22
PCBP2Q15366 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.229e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.179e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 BICRA-203ENST00000602258 3312 nt15.48■□□□□ 0.071e-8■■■■□ 22
PCBP2Q15366 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.296e-11■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CDC42EP4-205ENST00000580315 1022 ntTSL 223.39■■□□□ 1.332e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CDC42EP4-204ENST00000579611 580 ntTSL 415.88■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CDC42EP4-207ENST00000581045 539 ntTSL 412.43□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ACTN1-214ENST00000555075 828 ntTSL 311.51□□□□□ -0.573e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ACTN1-216ENST00000556083 4674 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.763e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 AGRN-202ENST00000419249 861 ntTSL 317.46■□□□□ 0.399e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ASGR1-206ENST00000573596 2083 ntTSL 517.71■□□□□ 0.433e-27■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ASGR1-205ENST00000573083 855 ntTSL 39.45□□□□□ -0.93e-27■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CADM1-210ENST00000540951 572 ntTSL 318.74■□□□□ 0.595e-8■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CADM1-211ENST00000541434 1112 ntTSL 1 (best)15.28■□□□□ 0.045e-8■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CADM1-214ENST00000543249 565 ntTSL 45.73□□□□□ -1.495e-8■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CPSF7-223ENST00000544669 1800 ntTSL 512.93□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CPSF7-218ENST00000537641 1728 ntTSL 511.95□□□□□ -0.59e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CPSF7-211ENST00000477890 1234 ntTSL 510.74□□□□□ -0.699e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 CPSF7-219ENST00000539952 953 ntTSL 55.5□□□□□ -1.539e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZYX-205ENST00000446634 926 ntTSL 517.38■□□□□ 0.376e-8■■■■□ 22
PCBP2Q15366 ZYX-204ENST00000436448 632 ntTSL 416.57■□□□□ 0.246e-8■■■■□ 22
PCBP2Q15366 DGUOK-206ENST00000489796 692 ntTSL 39.59□□□□□ -0.873e-9■■■■□ 22
PCBP2Q15366 GALNT1-206ENST00000591924 542 ntTSL 320.23■□□□□ 0.833e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 GALNT1-202ENST00000586725 272 ntTSL 512.84□□□□□ -0.353e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.048e-7■■■■□ 22
PCBP2Q15366 F2-202ENST00000442468 1031 ntTSL 319.6■□□□□ 0.731e-19■■■■□ 22
PCBP2Q15366 PVT1-202ENST00000512617 383 ntTSL 33.9□□□□□ -1.796e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.673e-6■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 GMDS-AS1-203ENST00000524770 565 ntTSL 319.04■□□□□ 0.647e-8■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 GMDS-AS1-209ENST00000532124 629 ntTSL 419.04■□□□□ 0.647e-8■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 GMDS-AS1-206ENST00000530346 594 ntTSL 417.06■□□□□ 0.327e-8■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.077e-8■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 GMDS-AS1-208ENST00000531092 744 ntTSL 312.29□□□□□ -0.447e-8■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 MDC1-207ENST00000492462 819 ntTSL 311.01□□□□□ -0.651e-10■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.857e-8■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 MDC1-203ENST00000417033 916 ntTSL 27.78□□□□□ -1.161e-10■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-6■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 TNFRSF1A-214ENST00000543048 571 ntTSL 59.14□□□□□ -0.951e-6■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.336e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 SPON2-207ENST00000504871 581 ntTSL 423.63■■□□□ 1.377e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 SPON2-204ENST00000502483 571 ntTSL 423.27■■□□□ 1.327e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.147e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 SPON2-220ENST00000515004 571 ntTSL 420.85■□□□□ 0.937e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 SPON2-212ENST00000509233 549 ntTSL 417.7■□□□□ 0.427e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 SPON2-215ENST00000511672 557 ntTSL 416.15■□□□□ 0.187e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.117e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 SPON2-216ENST00000511679 556 ntTSL 514.27□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 CNOT3-210ENST00000618939 4516 ntTSL 513.5□□□□□ -0.257e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 SPON2-210ENST00000506266 462 ntTSL 412.32□□□□□ -0.447e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 PPP5C-215ENST00000595055 556 ntTSL 222.54■■□□□ 1.28e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 PPP5C-212ENST00000527193 548 ntTSL 321.74■■□□□ 1.078e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 PPP5C-203ENST00000467502 1235 ntTSL 215.81■□□□□ 0.128e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 PPP5C-214ENST00000532058 1970 ntTSL 414.86□□□□□ -0.038e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 PPP5C-210ENST00000493347 431 ntTSL 314.25□□□□□ -0.138e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 CNN2-211ENST00000606983 537 ntTSL 310.89□□□□□ -0.673e-6■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 SLC13A3-203ENST00000372121 848 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 TGIF2-206ENST00000560025 923 ntTSL 317.82■□□□□ 0.441e-12■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.041e-12■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.151e-12■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 TGIF2-204ENST00000558028 638 ntTSL 214.1□□□□□ -0.151e-12■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-12■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 TGIF2-208ENST00000611732 3344 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.911e-12■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.23e-7■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 ATG4B-221ENST00000483778 1103 ntTSL 316.59■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 ATG4B-202ENST00000400771 663 ntTSL 514.51□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 ATG4B-215ENST00000468018 721 ntTSL 514.3□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 21.9
PCBP2Q15366 ATG4B-209ENST00000425239 807 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 21.9
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