Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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