Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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