Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRSQ13332 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms