Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CDK5R2Q13319 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CDK5R2Q13319 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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