Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HSPB3Q12988 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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