Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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