Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCB1Q12824 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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