Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms