Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EGR3Q06889 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EGR3Q06889 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EGR3Q06889 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EGR3Q06889 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EGR3Q06889 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EGR3Q06889 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EGR3Q06889 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms