Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms