Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms