Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A1P68400 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms