Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPS4XP62701 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms