Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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