Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
SMARCA2P51531 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms