Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB5CP51148 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms