Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP153P49790 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP153P49790 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP153P49790 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP153P49790 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms