Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DESP17661 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DESP17661 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DESP17661 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms