Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms