Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms