Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLUP10909 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLUP10909 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLUP10909 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms