Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFLP07196 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFLP07196 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFLP07196 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEFLP07196 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEFLP07196 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEFLP07196 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEFLP07196 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEFLP07196 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEFLP07196 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms