Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms