Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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PDE6DO43924 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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